这道初中历史题的正确答案为：

C

解题思路
本题主要考查台湾问题的由来，回顾已学知识可知甲午中日战争中国战败签订《马关条约》，日本割占了台湾使台湾与祖国分离；抗日战争中国胜利，收回了对台湾的主权；抗日战争结束后国民党发动内战，最后战败退回台湾，再次使台湾与祖国大陆分离，故选C。