这道初中历史题的正确答案为：

D

解题思路
本题考查的是乾隆皇帝时的史实。郑成功收复台湾，时值明末清初；康熙皇帝组织雅克萨反击战；设置驻藏大臣的是雍正皇帝；乾隆帝平定回部贵族大小和卓的叛乱，并设置伊犁将军管理新疆地区，故选D项。