学校现有和平校区、五里铺校区、定西校区及甘南校区四个校区，形成“一校四区”办学格局，有4所直属附属医院，7所非直属附属医院，共129家实践教学基地。目前学校馆藏纸质文献资源总量达70.1539万册，其中纸质图书60余万册、馆藏线装古籍2.3809万册、外文图书2.956万册、纸质期刊4.327万册；拥有各类数据库49个，电子图书74.9万种，电子期刊18772种。近五年来，承担国家、省部级和其他科研课题732项，获得各类科研成果奖励78项，获国家专利32项。出版学术专著及教材533部，发表学术论文2164篇。主办《甘肃中医药大学学报》《中医儿科杂志》《甘肃基层卫生》三种学术期刊，其中《中医儿科杂志》为中华中医药学会系列期刊。