1997年10月，与青海畜牧兽医学院合并； 2001年1月，青海省农林科学院、青海省畜牧兽医科学院、青海财经职业学院整建制划归青海大学；2004年11月，与青海医学院整合组建为新的青海大学。 学校现有8个校区，占地2873亩，固定资产总值6.09亿元,校舍建筑面积54.9万平方米。拥有教学、科研实验室（中心）58个，教学科研仪器设备值6550.3万元、医疗仪器设备值14907.7万元；图书馆藏书109余万册。 青海大学目前设有医学院（含附属医院）、农牧学院、化工学院、财经学院、农林科学院、畜牧兽医科学院等6院、29个系、12个研究所（中心）；共有55个本科专业、33个专科专业，23个硕士点,2个博士点；有21个省级重点学科、3个省级特色专科和13个省级重点实验室、1个省级实训基地；1个教育部重点实验室,1个省部共建教育部重点实验室。 学科主要涵盖工、农、医、管四大学科门类，学科专业设置与青海的支柱产业和优势产业密切相关，并在高原农牧业、高原医学、盐湖化工、黄河水电资源开发等方面形成了自己独有的学科优势和办学特色。 随着西部大开发战略的实施，青海大学在高层次应用型人才资源开发中将发挥不可替代的重要作用。1999年被省委、省政府确定为省内重点建设的大学，2000年被国家确定为重点支持的西部地区高校之一，2001年国家教育部指定清华大学对口支援青海大学，2002年顺利通过教育部本科教学工作水平评估，2003年实现农科类硕士点零的突破，2004年实现了省部共建，2006年被批准为博士学位授予权单位。