这道初中生物题的正确答案为：

A

解题思路
A、草履虫、酵母菌细胞中没有叶绿体，眼虫细胞内有叶绿体，能进行光合作用，A错误；
B、用显微镜观察草履虫、眼虫和酵母菌，发现酵母菌细胞内有明显的液泡，B正确；
C、用显微镜观察草履虫、眼虫和酵母菌，发现他们的细胞内都有真正的细胞核，C正确；
D、草履虫、眼虫和酵母菌的整个身体虽然只有一个细胞构成，但能完成呼吸、排泄、生殖等生理活动，D正确；
故选A。