这道初中物理题的正确答案为：

B．

解题思路

A、北京天坛里的回音壁，三音石，圜丘三处建筑有非常美妙的声音现象，它是我国古代建筑师利用声音的多次反射造成的音响效果，该选项说法正确，不符合题意；
B、飞船内有空气，航天员可以直接交流，飞船外没有空气，就必须借助电子通信设备交流了，该选项说法不正确，符合题意；
C、我们能分辨不同人的讲话，不同乐器的演奏是根据不同物体发出声音的音色是不同，该选项说法正确，不符合题意；
D、超声能破坏细菌结构，从而可以对医疗器械和食物进行杀菌消毒，实际上是利用了超声传递能量，该选项说法正确，不符合题意．
故选B．