这道初中道德与法治题的正确答案为：

（1）名誉权、隐私权、肖像权（3分） （2）①李某的行为是践踏他人人格尊严、损害他人的名誉，给他人造成了伤害；②破坏了社会道德，危害社会秩序；③同时也是不尊重自己，损害自己的违法行为。（言之有理即可）（9分） （3）①林某可以和侵权人协商，告知李某的行为是违法的，要求李某停止侵害，赔礼道歉；②也可以向有关部门提起诉讼，运用法律武器，维护自己的合法权益。（提出的办法合理合法可行即可）（8分）

解题思路
（1）李某用有照相功能的手机偷拍了林某在寝室内的各种生活照片侵犯了林某的肖像权和隐私权；无中生有，捏造事实重伤林某是侵犯了林某的名誉权。
（2）李某没有尊重林某，同样也不会得到别人的尊重，偷拍别人并无中生有，捏造事实重伤林某，是一种违法行为，侵犯了他人的人格尊严，损害他人的名誉，破坏了社会道德，危害社会秩序，最终要受到法律的制裁和舆论的谴责。
（3）根据教材知识，林某可以和侵权人协商，告知李某的行为是违法的，要求李某停止侵害，赔礼道歉；②也可以向有关部门提起诉讼，运用法律武器，维护自己的合法权益。
（2）侵犯他人合法权益的危害。
（3）怎样维护自己的合法权益。