这道初中历史题的正确答案为：

（1）西域都护 （2）台湾府    （3）元朝

解题思路 本题考查的是历史上对边疆地区进行有效管辖的措施。标志着新疆正式归属中央管辖的管理机构是西域都护；清朝时期加强对台湾的管理而设立的行政机构是台湾府；今西藏地区正式成为我国的一个行政区是在元朝。