这道初中化学题的正确答案为：

B

解题思路 A、三大化石燃料是煤、石油、天然气，故A正确；
B、极少数不活泼的金属以单质的形式存在，如铂，仅、银等，其余大多数以化合物存在．故B错误；
C、造成温室效应的主要物质是二氧化碳还有甲烷、臭氧等物质，故C正确；
D、由于化石燃料属于不可再生能源，并且污染严重，现在正在开发无污染、可再生的新能源，有太阳能、水能、风能，潮汐能、核能等，故D正确；
故选D．